部門利益是指行政部門偏離公共利益導(dǎo)向，追求部門局部利益，變相實(shí)現(xiàn)小團(tuán)體或少數(shù)領(lǐng)導(dǎo)個(gè)人的利益。
    在討論部門利益之前，我們應(yīng)首先弄清政府各部門是不是利益主體?
    首先應(yīng)承認(rèn)政府部門也是一個(gè)行為主體，但這個(gè)行為主體是代表公眾利益的行為主體，或者叫公眾利益主體;其次，作為公眾利益主體的政府部門，有自己的正當(dāng)利益，但必須對(duì)這個(gè)正當(dāng)利益進(jìn)行嚴(yán)格界定，政府部門不是獨(dú)立的特殊的利益主體，因而一定要把它的特殊利益排除掉;第三，作為公眾利益主體的政府部門，在進(jìn)行相關(guān)決策及公務(wù)執(zhí)行過程中，必須從公共利益出發(fā)，不僅不能過多地從本部門利益出發(fā)，而是根本就不能從本部門利益出發(fā)，這是一個(gè)定性的問題，而非量的問題，必須要把這條縫隙堵上。因此，必須解決部門利益問題。
    我國(guó)“部門利益”問題的現(xiàn)狀：
    一、部門利益問題導(dǎo)致行政效率的降低。在具體行政過程中，有些政府部門對(duì)凡是能鞏固、謀取部門利益的，則積極“作為”;凡是與部門利益相抵觸、難以謀取部門利益的，則消極“不作為”。這使得一些能維護(hù)、增進(jìn)國(guó)家利益的重大決策(如《反壟斷法》、燃油稅、內(nèi)外企統(tǒng)一稅率、數(shù)字電視標(biāo)準(zhǔn)等)遲遲未形成共識(shí)而難以出臺(tái)，而一些對(duì)國(guó)家利益有消極影響的重大決策(教育產(chǎn)業(yè)化、醫(yī)療市場(chǎng)化、行業(yè)壟斷、外企“超國(guó)民待遇”以及很大一部分出口退稅等)遲遲難以取消或調(diào)整。行政執(zhí)法重事前審批、輕事后監(jiān)督管理，這也是礦難頻發(fā)的重要原因。
    二、部門利益問題助長(zhǎng)行政****。部門職權(quán)與資源配置結(jié)合的一個(gè)重要體現(xiàn)就是審批(特許與壟斷經(jīng)營(yíng)權(quán)等)。由于缺乏必要的監(jiān)督，審批必然引起“尋租”盛行，導(dǎo)致行政****。如國(guó)家某“委”本應(yīng)是一個(gè)主管中長(zhǎng)期規(guī)劃的超脫部門，但實(shí)際上，既承擔(dān)宏觀調(diào)控，又負(fù)責(zé)項(xiàng)目審批，權(quán)力過度集中。實(shí)踐證明，部門利益必然使之忽略宏觀趨勢(shì)把握，重視具體項(xiàng)目審批;借宏觀調(diào)控之名，強(qiáng)化行政審批。例如2004年全年審批20萬元及以下項(xiàng)目高達(dá)800個(gè)，與該“委”職工數(shù)相當(dāng)。這不僅造成宏觀調(diào)控手段的錯(cuò)位(以行政手段代替經(jīng)濟(jì)手段)，而且引發(fā)與其他中央政府部門職責(zé)沖突，并和相關(guān)地區(qū)、行業(yè)利益緊密連在一起，成為中央政府部門之間、中央政府與地方政府之間的矛盾焦點(diǎn)。
    三、部門利益問題導(dǎo)致經(jīng)濟(jì)運(yùn)行成本的增加。部門利益膨脹使得機(jī)構(gòu)臃腫，人浮于事，“隱形超編”(從外部“借調(diào)”)普遍，導(dǎo)致國(guó)家財(cái)政收入開支50%以上用于“養(yǎng)人”(發(fā)達(dá)國(guó)家一般在20%左右)。某教育機(jī)構(gòu)年招收學(xué)員約1200人，而在冊(cè)工作人員1400多人，農(nóng)民工1500多人，退休員工800多人，教職員與學(xué)員的比例約為3:1，效率明顯低下。部門利益膨脹使得行政收費(fèi)難以清理取消，損害了市場(chǎng)機(jī)制作用的充分發(fā)揮。借權(quán)謀利正使公權(quán)部門向自利性組織演變。研究顯示，各級(jí)政府部門每年收費(fèi)總收入約為8000億元。若能夠規(guī)范清理收費(fèi)，全國(guó)每年將增加60萬～80萬戶中小企業(yè)，可新增600萬～800萬個(gè)就業(yè)崗位。能源、電信、鐵路等行業(yè)，借助壟斷，維持壟斷高價(jià)，獲得壟斷利潤(rùn)，造成財(cái)富分配扭曲和資源配置惡化，“煤電油運(yùn)”全面緊張與行業(yè)壟斷存在緊密關(guān)聯(lián)。
    四、部門利益問題增大國(guó)家經(jīng)濟(jì)風(fēng)險(xiǎn)。長(zhǎng)期以來，先部門利益后國(guó)家利益，重部門利益輕國(guó)家利益，以部門利益取代國(guó)家利益，甚至為部門利益而不惜犧牲、損害國(guó)家利益等行為，影響社會(huì)經(jīng)濟(jì)的健康發(fā)展，增大國(guó)家的經(jīng)濟(jì)風(fēng)險(xiǎn)。部門利益的一個(gè)重要外在體現(xiàn)，就是機(jī)構(gòu)超編、預(yù)算超支，由此造成財(cái)政開支壓力不斷增大，使得政府本應(yīng)承擔(dān)的義務(wù)教育、公共衛(wèi)生、社會(huì)保障等公益事業(yè)得不到有效實(shí)施。正是由于部門利益作祟，外企長(zhǎng)期享受“超國(guó)民待遇”未能適時(shí)調(diào)整，這不僅不利于中資企業(yè)與民營(yíng)經(jīng)濟(jì)的發(fā)展，而且加重我經(jīng)濟(jì)對(duì)外依賴。更不利的后果，是制約我有關(guān)產(chǎn)業(yè)的長(zhǎng)遠(yuǎn)發(fā)展，使得國(guó)內(nèi)比較完善的獨(dú)立自主的工業(yè)體系嚴(yán)重受損，尤其是作為“工業(yè)之母”的裝備制造業(yè)面臨嚴(yán)峻態(tài)勢(shì)，國(guó)民經(jīng)濟(jì)的重要行業(yè)“排頭兵”有些為外資企業(yè)所控制。由于行政力量保護(hù)，壟斷企業(yè)內(nèi)部治理普遍存在嚴(yán)重缺陷，隱含著重大經(jīng)濟(jì)風(fēng)險(xiǎn)，“中航油”、“中棉儲(chǔ)”以及國(guó)有銀行大案要案不斷等，就是集中體現(xiàn)。
    五、部門利益問題增大國(guó)家政治風(fēng)險(xiǎn)。人民政府職能部門如果不代表人民利益，而是代表集團(tuán)或個(gè)人利益，損害大眾利益，必然損害政府的公信力與權(quán)威，損害黨與政府在人民中的形象。一些部門決策往往反映的是強(qiáng)勢(shì)集團(tuán)的利益，社會(huì)大眾尤其是困難群體的利益被嚴(yán)重忽視。因?yàn)椴块T利益，政府袒護(hù)地產(chǎn)開發(fā)商，被拆遷戶利益得不到保障，“抗法”與“上訪”不斷;火車票每年到點(diǎn)調(diào)價(jià)，而且總在普遍反對(duì)聲中“聽證成功”，引發(fā)大眾不滿;工商、質(zhì)檢等肆意收費(fèi)，導(dǎo)致創(chuàng)業(yè)艱、就業(yè)難等。部門利益使一些改革片面追求經(jīng)濟(jì)效益、嚴(yán)重偏離社會(huì)公正方向，威脅社會(huì)穩(wěn)定與和諧。