生物堿的溶解性與生物堿分子結(jié)構(gòu)中氮原子的存在狀態(tài)、分子大小、分子中極性基團(tuán)的種類和數(shù)目以及溶劑的種類有關(guān)。
    （一）游離生物堿
    1.親脂性生物堿
    多數(shù)具仲胺和叔胺氮原子的生物堿有較強(qiáng)的脂溶性，易溶于乙醚、苯和鹵烴類（二氯甲烷、氯仿、四氯化碳等）等有機(jī)溶劑中，尤其在氯仿中溶解度較大；可溶于甲醇、乙醇、丙酮、乙酸乙酯等；不溶或難溶于水，但易溶于酸水。
    2.親水性生物堿
    （1）季銨型生物堿
    這類生物堿為離子型化合物，易溶于水和酸水，可溶于甲醇、乙醇、正丁醇等極性較大的有機(jī)溶劑，難溶于親脂性有機(jī)溶劑。
    （2）含N-氧化物
    結(jié)構(gòu)的生物堿這類生物堿具配位鍵結(jié)構(gòu)，可溶于水，如氧化苦參堿。
    （3）小分子生物堿
    少數(shù)分子較小而堿性較強(qiáng)的生物堿，既可溶于水，也可溶于氯仿，如麻黃堿、煙堿等。
    （4）酰胺類生物堿
    酰胺在水中可形成氫鍵，所以在水中有一定的溶解度，如秋水仙堿、咖啡堿。
    3.具有特殊官能團(tuán)的生物堿
    （1）具有酚羥基或羧基的生物堿
    這類生物堿稱為兩性生物堿，既可溶于酸水，也可溶于堿水溶液。具有酚羥基的生物堿（常稱為酚性生物堿），可溶于氫氧化鈉等強(qiáng)堿性溶液，如嗎啡；具有羧基的生物堿可溶于碳酸氫鈉溶液，如檳榔次堿。
    （2）具有內(nèi)酯或內(nèi)酰胺結(jié)構(gòu)的生物堿
    這類生物堿在正常情況下，其溶解性類似一般叔胺堿，但在強(qiáng)堿性溶液中加熱，其內(nèi)酯（或內(nèi)酰胺）結(jié)構(gòu)可開環(huán)形成羧酸鹽而溶于水中，酸化后環(huán)合析出。如喜樹堿、苦參堿等。
    特殊情況：
    如嗎啡為酚性生物堿，但難溶于氯仿、乙醚；石蒜堿難溶于有機(jī)溶劑，而溶于水；喜樹堿不溶于一般有機(jī)溶劑，而溶于酸性氯仿等。
    （二）生物堿鹽
    生物堿鹽一般易溶于水，可溶于甲醇、乙醇，難溶或不溶于親脂性有機(jī)溶劑。
    生物堿在酸水中成鹽溶解，調(diào)堿性后又游離析出沉淀，可利用此性質(zhì)提取分離生物堿。
    生物堿鹽在水中的溶解性因其成鹽的種類不同而有差異。
    生物堿的無機(jī)酸鹽＞大于有機(jī)酸鹽；
    無機(jī)酸鹽中含氧酸鹽＞大于鹵代酸鹽；
    小分子有機(jī)酸鹽大＞大分子有機(jī)酸鹽。
    某些生物堿鹽難溶于水，如小檗堿鹽酸鹽、麻黃堿草酸鹽等難溶于水。