【輔助檢查】
（一）白細胞計數(shù) 起病第1周末及痙咳早期，白細胞計數(shù)多增高，一般在2萬～3萬/mm3或更高，淋巴細胞占60%～80%.如有繼發(fā)感染時，淋巴細胞即相對減少。
（二）細胞培養(yǎng) 起病初取鼻咽拭子、痙咳期用咳碟法收集標本，用B-G培養(yǎng)基作細菌培養(yǎng)，早期陽性率較高。卡他期初陽性率可達90%，痙咳期一般低于50%，痙咳2～3周后，培養(yǎng)幾乎全部陰性。用直接熒光抗體染色法去檢測培養(yǎng)基上的百日咳桿菌菌落是可靠的方法。
（三）熒光抗體染色法 檢查用鼻咽拭子涂片，有快速診斷的優(yōu)點，但本法特異性差，僅作輔助培養(yǎng)之用。
（四）血清學檢查 作雙份血清凝集試驗及補結(jié)合試驗，如抗體效價遞升可予確診。近有用酶聯(lián)免疫吸附試驗測IgM、IgG和IgA抗體，對早期診斷有所幫助。也有用單份恢復期血清凝集抗體1∶320效價作為陽性診斷值者。
其他檢測百日咳桿菌或其組成成分的方法有斑點雜交法、PCR法、組織細胞培養(yǎng)的形態(tài)、酶的活力等尚處于實驗室或臨床觀察階段，還未被普遍應用。
【鑒別診斷】
下列疾病應與百日咳相鑒別。
（一）急性支氣管炎和肺炎 由乙型流感桿菌、腺病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒等引起的支氣管炎，咳嗽較劇烈，常有痙咳。但劇烈咳嗽在起病數(shù)日內(nèi)即出現(xiàn)，痙咳后無雞鳴樣回聲，夜間不一定加重，急性期全身感染中毒癥狀如喘咳、氣促較重，肺部常有固定的干濕啰音，白細胞計數(shù)正?；蚱?。經(jīng)適當治療后，癥狀在短期內(nèi)減輕或消失。
（二）支氣管淋巴結(jié)結(jié)核 腫大的淋巴結(jié)壓迫支氣管，或侵蝕支氣管壁，可引起痙攣性咳嗽，但無雞鳴樣回聲?？筛鶕?jù)結(jié)核病中毒癥狀、結(jié)核菌素試驗、肺部X線改變等作出診斷。
（三）氣管支氣管異物 可突然發(fā)生陣發(fā)性痙咳，有異物吸入史，白細胞不增高，X線可見節(jié)段性肺不張，作支氣管鏡檢查可發(fā)現(xiàn)異物。
（四）百日咳綜合征 在普遍進行百日咳預防免疫的人群中，仍可有散發(fā)的“百日咳”病例出現(xiàn)。常分離出腺病毒、其他呼吸道病毒、肺炎支原體和副百日咳桿菌等，而無百日咳桿菌。其臨床癥狀、肺部X線表現(xiàn)和血象所見，與典型百日咳有似之處，需靠病原學檢查鑒別。據(jù)估計，約20%的病例系由上述病原所致。衣原體感染可有類似百日咳樣咳嗽，但無雞鳴樣回聲。副百日咳桿菌引起者癥狀輕，病程短。
【預防】
（一）隔離傳染源 對本病患者嚴格執(zhí)行呼吸道隔離，是重要的預防環(huán)節(jié)。隔離期自起病開始，為期7周；或痙咳開始，為期4周。密切接觸的易感兒（特別在集體機構(gòu)中）需檢疫3周。成人患者需注意避免接觸小兒。疫源地只需通風換氣。
（二）保護易感者
1.主動免疫 目前常用白百破（DPT，白喉類毒素、百日咳疫苗、破傷風類毒素）三聯(lián)疫苗，對出生3～6個月的嬰兒進行基礎(chǔ)免疫，皮下注射三次。在流行期，1個月的患兒即可接受疫苗接種。強調(diào)全程免疫，以后再按規(guī)定加強。百日咳疫苗偶可引起腦病等神經(jīng)性反應，故原有腦部疾患或驚厥性疾病、或首劑百日咳疫苗注射后曾有驚厥者，一概不應再予注射。乙型腦炎流行季節(jié)也不進行百日咳疫苗注射?，F(xiàn)用的全細胞百日咳疫苗雖發(fā)揮了一定的作用但效果尚不夠理想，免疫后再患百日咳的兒童和成人發(fā)病者屢有報道。
無細胞百日咳疫苗：即使用百日咳桿菌的某些組成部分，而不是用全個百日咳桿菌制成的百日咳疫苗，其保護效果較全細胞百日咳疫苗好，同時避免了全細胞疫苗的副反應。1981年日本Sato開始用以百日咳毒素（Pertussiu Toxin PT）和絲狀血凝素（Filamentous hemagglutmin FHA）為主要組分的無細胞百日咳疫苗獲得成功。英、美、瑞典等國家隨后研制各種無細胞百日咳組分的疫苗用于人群最得效果。已證實無論何種無細胞百日咳組分疫苗，百日咳毒素（PT）抗原是必不可少的成分。進一步研究揭示百日咳毒素單克隆抗體（PT-McAb）具有特異性中和體外和體內(nèi)百日咳毒素的多種生物學活性的特征，同時也具有防御百日咳桿菌感染的保護作用。
2.被動免疫 對幼嬰或體弱者，于接觸病人后可給百日咳高效價免疫球蛋白，但預防和減輕癥狀的效果不顯著，故應用者少。
（三）藥物預防 嬰兒接觸病人后，即給紅霉素每日50mg/kg，分4次口服，連用10～14天，效果較好。
【預后】
與患者年齡、一般健康情況、有無并發(fā)癥有關(guān)。近年來由于多能早期治療，病死率顯著降低；但新生兒和幼嬰易并發(fā)肺炎和腦病，預后仍危重。佝僂病患兒感染百日咳，病情多較重。
（一）白細胞計數(shù) 起病第1周末及痙咳早期，白細胞計數(shù)多增高，一般在2萬～3萬/mm3或更高，淋巴細胞占60%～80%.如有繼發(fā)感染時，淋巴細胞即相對減少。
（二）細胞培養(yǎng) 起病初取鼻咽拭子、痙咳期用咳碟法收集標本，用B-G培養(yǎng)基作細菌培養(yǎng)，早期陽性率較高。卡他期初陽性率可達90%，痙咳期一般低于50%，痙咳2～3周后，培養(yǎng)幾乎全部陰性。用直接熒光抗體染色法去檢測培養(yǎng)基上的百日咳桿菌菌落是可靠的方法。
（三）熒光抗體染色法 檢查用鼻咽拭子涂片，有快速診斷的優(yōu)點，但本法特異性差，僅作輔助培養(yǎng)之用。
（四）血清學檢查 作雙份血清凝集試驗及補結(jié)合試驗，如抗體效價遞升可予確診。近有用酶聯(lián)免疫吸附試驗測IgM、IgG和IgA抗體，對早期診斷有所幫助。也有用單份恢復期血清凝集抗體1∶320效價作為陽性診斷值者。
其他檢測百日咳桿菌或其組成成分的方法有斑點雜交法、PCR法、組織細胞培養(yǎng)的形態(tài)、酶的活力等尚處于實驗室或臨床觀察階段，還未被普遍應用。
【鑒別診斷】
下列疾病應與百日咳相鑒別。
（一）急性支氣管炎和肺炎 由乙型流感桿菌、腺病毒、呼吸道合胞病毒、副流感病毒等引起的支氣管炎，咳嗽較劇烈，常有痙咳。但劇烈咳嗽在起病數(shù)日內(nèi)即出現(xiàn)，痙咳后無雞鳴樣回聲，夜間不一定加重，急性期全身感染中毒癥狀如喘咳、氣促較重，肺部常有固定的干濕啰音，白細胞計數(shù)正?；蚱?。經(jīng)適當治療后，癥狀在短期內(nèi)減輕或消失。
（二）支氣管淋巴結(jié)結(jié)核 腫大的淋巴結(jié)壓迫支氣管，或侵蝕支氣管壁，可引起痙攣性咳嗽，但無雞鳴樣回聲?？筛鶕?jù)結(jié)核病中毒癥狀、結(jié)核菌素試驗、肺部X線改變等作出診斷。
（三）氣管支氣管異物 可突然發(fā)生陣發(fā)性痙咳，有異物吸入史，白細胞不增高，X線可見節(jié)段性肺不張，作支氣管鏡檢查可發(fā)現(xiàn)異物。
（四）百日咳綜合征 在普遍進行百日咳預防免疫的人群中，仍可有散發(fā)的“百日咳”病例出現(xiàn)。常分離出腺病毒、其他呼吸道病毒、肺炎支原體和副百日咳桿菌等，而無百日咳桿菌。其臨床癥狀、肺部X線表現(xiàn)和血象所見，與典型百日咳有似之處，需靠病原學檢查鑒別。據(jù)估計，約20%的病例系由上述病原所致。衣原體感染可有類似百日咳樣咳嗽，但無雞鳴樣回聲。副百日咳桿菌引起者癥狀輕，病程短。
【預防】
（一）隔離傳染源 對本病患者嚴格執(zhí)行呼吸道隔離，是重要的預防環(huán)節(jié)。隔離期自起病開始，為期7周；或痙咳開始，為期4周。密切接觸的易感兒（特別在集體機構(gòu)中）需檢疫3周。成人患者需注意避免接觸小兒。疫源地只需通風換氣。
（二）保護易感者
1.主動免疫 目前常用白百破（DPT，白喉類毒素、百日咳疫苗、破傷風類毒素）三聯(lián)疫苗，對出生3～6個月的嬰兒進行基礎(chǔ)免疫，皮下注射三次。在流行期，1個月的患兒即可接受疫苗接種。強調(diào)全程免疫，以后再按規(guī)定加強。百日咳疫苗偶可引起腦病等神經(jīng)性反應，故原有腦部疾患或驚厥性疾病、或首劑百日咳疫苗注射后曾有驚厥者，一概不應再予注射。乙型腦炎流行季節(jié)也不進行百日咳疫苗注射?，F(xiàn)用的全細胞百日咳疫苗雖發(fā)揮了一定的作用但效果尚不夠理想，免疫后再患百日咳的兒童和成人發(fā)病者屢有報道。
無細胞百日咳疫苗：即使用百日咳桿菌的某些組成部分，而不是用全個百日咳桿菌制成的百日咳疫苗，其保護效果較全細胞百日咳疫苗好，同時避免了全細胞疫苗的副反應。1981年日本Sato開始用以百日咳毒素（Pertussiu Toxin PT）和絲狀血凝素（Filamentous hemagglutmin FHA）為主要組分的無細胞百日咳疫苗獲得成功。英、美、瑞典等國家隨后研制各種無細胞百日咳組分的疫苗用于人群最得效果。已證實無論何種無細胞百日咳組分疫苗，百日咳毒素（PT）抗原是必不可少的成分。進一步研究揭示百日咳毒素單克隆抗體（PT-McAb）具有特異性中和體外和體內(nèi)百日咳毒素的多種生物學活性的特征，同時也具有防御百日咳桿菌感染的保護作用。
2.被動免疫 對幼嬰或體弱者，于接觸病人后可給百日咳高效價免疫球蛋白，但預防和減輕癥狀的效果不顯著，故應用者少。
（三）藥物預防 嬰兒接觸病人后，即給紅霉素每日50mg/kg，分4次口服，連用10～14天，效果較好。
【預后】
與患者年齡、一般健康情況、有無并發(fā)癥有關(guān)。近年來由于多能早期治療，病死率顯著降低；但新生兒和幼嬰易并發(fā)肺炎和腦病，預后仍危重。佝僂病患兒感染百日咳，病情多較重。