根據(jù)歷史記載，哈薩克的先祖最遠古的信仰是自然神靈崇拜，如日、月、大山、巨石、星辰、山洞、溫泉等以及圖騰崇拜、祖先崇拜，繼后又信仰薩滿教、佛教、景教。特別是佛教在新疆延續(xù)二千多年的歷史。如 1959年在哈密天山板房溝發(fā)現(xiàn)的古突厥文《彌勒會見記》，該作是以佛經(jīng)故事為題材的大型話劇劇本，主要宣揚生死輪回，因果報應諸方面的佛教教義。解放后在哈密還發(fā)現(xiàn)一本《彌勒三彌底經(jīng)》（1959年《新疆宗教》54頁）是由焉耆語譯成回紇語的小乘佛典。哈密白楊溝佛教洞窟、東廟爾溝的佛教遺址，都可以說明佛教當時在哈密各民族中流傳的盛況。
    哈薩克族從崇拜自然神靈、崇拜祖先開始，又信仰過多種宗教。最后信仰了伊斯蘭教。據(jù)歷史記載和史學家的研究，伊斯蘭教約在12世紀就在新疆喀什一帶傳播，14世紀阿克蘇維吾爾族皈依了伊斯蘭教，15世紀吐魯番維吾爾族皈依了伊斯蘭教，并開始向哈密傳播，直到17世紀中葉，伊斯蘭教才真正成為哈密維吾爾族的一元化宗教。
    哈密哈薩克部落完全皈依伊斯蘭教要比哈密維吾爾皈依伊斯蘭教還要晚一些。
    一、哈薩克遠古時期對為然神靈的崇拜
    哈薩克遠古時代崇拜的自然神靈有日、月、星辰、天、地、水、火、溫泉、獨樹、山洞等。哈薩克對自然崇拜的習俗在現(xiàn)代生活中仍可明顯地找到遺跡。哈薩克指天為阿斯盤，也稱呼大耶。生活中忌諱向著天吐唾沫，女人不能對著天擠自己的奶，沒做什么壞事常對天發(fā)誓說：“老天會作證”。哈薩克和漢族同樣認為，天上的所有的繁星就是地上的人，如果看到一顆流星隕落，就說：“不好了！”，地上就有一個人要殞命。哈薩克民間認為太陽的光亮可以驅(qū)邪惡，在小孩入搖床時，要用火在搖床的上面前后左右燎一下，以驅(qū)邪惡。哈薩克氈房的門不論何時都是向東開，向著太陽。新娘入洞房要在火上由老年人倒上一碗酥油或者羊油，都是對太陽及火的崇拜。尊火為火娘娘，牲畜轉(zhuǎn)場要讓牲畜從兩堆火中間穿過，即要火娘娘消災避難。哈薩克忌諱向火中吹唾沫，不從火上跳過，也不打火，生怕惹怒了火娘娘。這都是原始的自然崇拜。哈薩克生活中嚴忌在泉水中和流水中小便，不拔地上的青草，認為草是介勒阿巴，即大地媽媽養(yǎng)育的，民間也稱天為父親，哈語叫阿斯盤阿塔，認為天父地母結(jié)合才有了大地上的萬物。民間傳說哈薩克的祖先對自然神靈有種種叫法，說地神為迪航巴巴，森林之神叫奧勒滿巴巴，山神叫塔烏巴巴，水神叫蘇依勒，風神叫介勒依勒，火神叫奧特阿娜…··哈薩克對動物、植物的崇拜都屬自然崇拜的范疇之內(nèi)，對依于生存的六畜之神更為崇拜，祈求保護神保護牲畜繁衍、平安發(fā)展。對于奉為“種子”的老公馬、公牛、老山羊和自己最愛的騎馬，一般不向別人出售，自己可做掃歐木，意為宰冬肉，把頭骨要放在高高的白楊樹上天葬。哈薩克賣了牲畜，當買主拉走時要用剪刀剪下一小撮毛，并吐上口水在手上小心地捻一下留下。賣了大牲畜要留下籠頭和緩繩，都是為了保著福運。生活中不慎巴奶子或酸奶倒在了地上，一定要鏟出去給狗吃，不能用腳踩，怕惹怒了六畜保護神而招來不幸。
    關于六畜保護神民間有很多傳說，說綿羊的保護神叫紹潘阿塔，山羊的保護神叫謝克謝克阿塔，牛的保護神叫贊格巴巴或叫四依勒阿塔，馬的保護神叫康巴勒阿塔，也叫兒勒克阿塔……舊時哈薩克認為六畜平安都是她們的保護神和惡魔拼搏的結(jié)果。
    據(jù)歷史記載的哈薩克遠祖烏孫和康居人，認為萬物有靈，對自然的一切都很崇拜。從哈密小堡巖畫就能看出遠古部族對自然崇拜的情景，小堡巖畫區(qū)地處小堡派出所旁邊西北角山坡上，山坡坐北望南，是一片非常豐富的巖畫群，有狼追羊的畫面，其中有一幅巖畫上，畫的是一群大角山羊，羊角上有明顯的節(jié)，后面很近的地方有一只母山羊，一只公山羊抬著頭，好像在做愛，公山羊的生殖器垂在地上，又粗又壯。可看出古代部族對生殖的崇拜，愿望牲畜繁衍旺盛。
    二、哈薩克的圖騰崇拜
    哈薩克民間崇拜的圖騰有狼和貓頭鷹?！皥D騰”一詞是印地安語的譯音，意為親屬或標記。哈薩克為什么要把狼和貓頭鷹崇拜為圖騰？據(jù)《史記·大宛列傳》稱“昆莫生棄子野。鳥嗛肉蜚其上，狼往乳之。單于怪，以為神，而收長之?！薄稘h書·張騫傳》也稱：“子昆莫新生，傅父布就翎候抱亡置草中，為求食，還，見狼乳之，又烏銜肉翔其旁，以為神，遂持歸匈奴，單于愛養(yǎng)之?！睘鯇O王昆莫棄荒野，狼不但沒有吃他，還給他喂奶，所以形成哈薩克的主體部落烏孫就把狼和貓頭鷹立為圖騰而加以崇拜。民間一些老人不讓詛咒狼，也不指著狼罵。
    狼，哈語叫卡斯尕勒，也叫報勒，該詞是由“卡斯克勒”一詞轉(zhuǎn)化而來，意為尊敬，即崇拜的意思，在哈薩克民間文學中，常常把狼喻為兇猛、勇敢的象征，民間有些老人把狼的踝骨帶在身上，說可以治病，也可以得到好運氣。有人為了使自己的孩子成為勇敢的人，命名叫卡斯尕勒拜，或者叫報勒拜，都是狼拜的意思。
    哈薩克的先祖把貓頭鷹作為圖騰崇拜的習俗流傳至今，哈薩克自己一般不打貓頭鷹，采集貓頭鷹的羽毛，大都是受猛禽傷害而脫落的羽毛。他們把貓頭鷹的頭、爪、毛釘在床邊上、壁氈上，以示崇拜，并認為可以驅(qū)邪保平安。近代哈薩克對貓頭鷹的崇拜更盛于對狼的崇拜，多把貓頭鷹的毛釘在姑娘的帽子上，哈語叫塔何亞，既漂亮又認為吉祥。也扎在賽馬的馬頭上，愿參賽的馬像貓頭鷹一樣兇猛飛快。青年男女訂親后，小伙送給姑娘一撮貓頭鷹的羽毛為信物，意為吉祥。哈薩克人也將貓頭鷹的毛扎在自己心愛的駝羔頭上，以示平安。遠地的親戚探親，送一撮貓頭鷹的羽毛，表示祝福。哈薩克在生活中視貓頭鷹為美麗、驅(qū)邪、避禍、吉祥、安寧的象征。這都是把貓頭鷹作為圖騰崇拜的古*俗的痕跡。
    三、哈薩克對祖先的崇拜
    哈薩克崇拜祖先的觀念至今保留，他們認為人雖死了，其靈魂還在?？糪試大\哈薩克民間有句俗語“靈魂是肉體的客人”，說人死了，靈魂就飛走了。所以民間有崇拜部落的頭人、部落的英雄、巫師、自己祖先靈魂的習俗，虔誠地辦理祖先的葬事，宰牲祭獻，大辦一周年大祭（阿斯拜勒等托雨）。當遇到災難、不幸時，要向祖靈宰牲祭獻，認為宰牲越多，祖靈越會滿意，祖靈就會施舍恩德，保佑擺脫困境。不生孩子的女人要到祖先的墳地上過夜祈禱，祈求生兒育女。傳說哈薩克的英雄阿爾哈勒克在一次征戰(zhàn)中，陷入了困境，將有被擊敗危險，他當即把自己的坐騎——一匹白馬宰了，祭獻祖靈，祈求祖靈佑助，最后祖靈顯了靈驗，很快就轉(zhuǎn)敗為勝。哈薩克人路經(jīng)祖先的墳地都要下馬，在墳前祈禱默念，祈求祖靈佑助避禍得福。
    哈薩克宰牲祭祖要講究毛色，要宰黃頭白羊或白頭羊，平日來了貴客也要宰黃頭白羊，因為哈薩克認為白色是純潔、正直、忠誠的象征。說一個人有“白色的胸懷”，就是形容這個人正直、忠厚、誠實。哈語譯音為“阿克空吾勒”。所以18世紀哈薩克的英雄賈民拜克的戰(zhàn)旗就是白色的，據(jù)說現(xiàn)在還被人完好無損地保存著。哈薩克每逢大型慶典都要宰二歲青灰色的白鼻子馬，也是基于這個習俗。