圣地牙哥加州大學(xué)的學(xué)士學(xué)院系統(tǒng)是該校的一個特色。其組織方式是從牛津大學(xué)和劍橋大學(xué)引用過來的，有點跟圣塔克魯茲加州大學(xué)(UCSC)和普林斯頓大學(xué)大學(xué)類似。每個學(xué)院有它自己的校園和學(xué)生宿舍，其學(xué)科也各不相同，每個學(xué)院的學(xué)科要求和學(xué)術(shù)哲學(xué)也各不相同。
    圣地牙哥加利福尼亞大學(xué)有六個學(xué)院:
    1.Revelle College
    2.John Muir College
    3.Thurgood Marshall College
    4.Earl Warren College
    5.Eleanor Roosevelt College
    6.Sixth College
    1964年建立的羅杰·瑞威學(xué)院是該校的第一個學(xué)院，其主要方向是經(jīng)典的文學(xué)藝術(shù)。1967年建立的約翰·繆爾學(xué)院是第二個學(xué)院，提供彈性且有選擇性的基本教育。1970年建立的瑟古德·馬歇爾學(xué)院強(qiáng)調(diào)合作和多文化主義。1974年建立的厄爾·沃倫學(xué)院強(qiáng)調(diào)全面化的教育，同時要求其學(xué)生選擇兩個不相關(guān)的學(xué)科作為主科。1988年建立的埃莉諾· 羅斯福學(xué)院強(qiáng)調(diào)全球化，其教育結(jié)合文化和跨學(xué)科，包含西方和非西方的文化。2002年建立的第六學(xué)院強(qiáng)調(diào)文化、藝術(shù)和技術(shù)中的歷史和哲學(xué)聯(lián)系。
    不論學(xué)生選擇哪個學(xué)院，他可以在圣地牙哥加利福尼亞大學(xué)所提供的任何學(xué)科里獲得學(xué)士學(xué)位。但是學(xué)院相學(xué)生頒發(fā)學(xué)士文件和舉行每個學(xué)員特有的畢業(yè)典禮。